基于位置关联性打分方程的人类转录因子结合位点的预测(英文) 杨磊;李前忠;左永春 【期刊名称】《内蒙古大学学报：自然科学版》 【年(卷),期】2009(40)1 【摘 要】转录因子结合位点的识别是阐明基因转录调控机制的重要环节,准确的转录因子结合位点的预测算法将有助于人们识别转录因子的目标基因,进而研究转录因子结合位点在上游调控区中的位置对转录调控的影响.然而,目前存在的预测转录因子结合位点的算法所得结果的特异性普遍较低,因此有必要提出一种新的有效的预测转录因子结合位点的算法.本文利用JASPAR数据库上的数据,在深入分析转录因子结合位点生物学特征的基础上,构建了考虑位点保守性和伪计数的位置关联性打分方程.预测结果表明,在最佳阈值之下,该算法对转录因子结合位点的假阳率低于0.01%. 【总页数】8页(P60-67) 【关键词】转录因子结合位点;位置关联性打分方程;最佳阈值 【作 者】杨磊;李前忠;左永春 【作者单位】内蒙古大学物理科学与技术学院理论生物物理研究室 【正文语种】中 文 【中图分类】Q61 【相关文献】 1.基于进化足迹法结合位置打分函数的转录因子结合位点预测 [J], 王世缘;王艳秋 2.基于碱基关联二联体位置权重矩阵预测酵母转录因子结合位点 [J], 杨科利;许强 3.基于位置关联权重矩阵及DNA结构信息预测人类剪接位点 [J], 张鹏飞;李前忠;左永春;李涛 4.基于位置关联性打分方程的果蝇转录因子结合位点的预测 [J], 杨磊;李前忠;左永春 5.基于位点保守性参量和位置权重矩阵预测酵母转录因子结合位点 [J], 杨科利;李前忠;林昊 因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买 本文来源：https://www.wddqw.com/doc/49662baa07a1b0717fd5360cba1aa81144318f8e.html