关于血液肿瘤二代测序报告单解读，您需要知道的。。。 随着二代测序技术的发展，越来越多血液科医生都会开展二代测序项目，但是很多医生对报告单结果一头雾水。所以今天我们简单谈谈如何看懂一份血液肿瘤二代测序报告。 鉴于大家对二代测序的相关知识了解程度参差不齐，我们总结出“一对二看三查四问”的四步法，大家可以作为参考来分析二代测序的结果。 “一对”：核对标本送检信息。养成良好的核对习惯，确定我们手里拿的报告正好是我们需要的，病人信息没错，送检项目没错。 “二看”：看测序结果。几乎所有报告单的测序结果都是分等级列表式呈现，通常会报出三类变异：强烈临床意义变异、可能临床意义变异以及意义未明变异。推荐临床医生重点查看前两类突变，而“意义未明变异”鉴于目前尚不清楚其临床指导意义，不要过于纠结而浪费时间，只需记录积累，将来再进行回顾性分析即可。测序结果通常以表格形式呈现，表头术语就是要交代清楚XX基因XX位置发生什么突变，突变频率是多少。这些表头术语解释通常在报告单的末尾。以下图为例，简洁明了地列出“基因”、“突变命名”和“突变频率”。 这个结果表示检测到I类变异有三个：其中DNMT3A发生了移码突变。其中“突变命名”均以人类基因组变异协会（HGVS）规范进行标准书写： 以DNMT3A为例进行移码突变的书写方式解释： 1. NM_175629.2是DNMT3A的一个转录本， 2. c.2374delC：c是cDNA序列，C是胞嘧啶，del是deletion 突变，SETBP1和SRSF2发生点突变；三类变异有一个：ETV6发生点缩写，c.2374delC表示cDNA序列第2374位胞嘧啶缺失， 3. p.R792fs: p是蛋白序列，R是精氨酸， fs是framshift缩写，p.R792fs表示蛋白序列第792位精氨酸发生移码突变， 4. 30.6%：表示DNMT3A这个突变占野生+突变总和的30.6%，即突变频率为30.6%。 以SETBP1为例进行点突变的书写方式解释： 1. NM_015559.2是SETBP1的一个转录本， 2. c.2608G>A: c是cDNA序列，G是鸟嘌呤，A是腺嘌呤，c.2608G>A表示cDNA序列地2608位鸟嘌呤突变为腺嘌呤， 3. p.G870S: p是蛋白序列，G是甘氨酸，S是丝氨酸，p.G870S表示蛋白序列第870位甘氨酸突变为丝氨酸， 4. 23%：表示SETBP1这个突变频率为23%。 以上点突变及移码突变是最常见的两种变异方式，想知道其他复杂的变异书写方式可参阅2001年发表在Hum Genet的文献“Nomenclature for the description of human sequence variations”。 有的报告单会把基因的突变频率写成“丰度”“变异比例”“VAF（variant allele frequency）”“MAF（mutant allele frequency）”等，通过突变频率可初步判断一下突变是体细胞突变（后天获得的）还是胚系突变（先天可遗传的），一般胚系突变的理论值是50%（杂合）或者100%（纯合），但在实际分析中，会把50%左右（如40%-60%）认为是胚系的杂合突变，90%-100%认为是胚系的纯合突变，其他比例的突变是体细胞突变的可能性大。但是判断是体细胞突变还是胚系突变，最好是有正常样本的对照，比如对口腔粘膜上皮细胞进行一代测序位点验证。对于体细胞突变，突变频率可以反映当前样本肿瘤细胞的克隆比例，对于以后样本复查有重要的参考价值。对于初诊标本，如存在多个基因突变，还可通过突变频率的高低大概判断一下基因突变发生的前后顺序，一般起始突变的突变频率都比较高，比如DNMT3A突变。 本文来源：https://www.wddqw.com/doc/6ff65b8a1937f111f18583d049649b6648d7099c.html