氰化物可经由口服、吸入及皮肤黏膜被吸收到体内。氰化物由於可以抑制多种酶,被吸收後和细胞中线粒体(mitochondria)上细胞色素氧化酶(cytochrome oxidase)三价铁离子产生络合物,抑制细胞氧化磷酸化作用(oxidative phosphylation),阻断能量ATP(adenosine triphosphate)的生成,并使得细胞缺氧窒息。
一般而言,对於微量的氰化物人体可藉由与变性血红素(methemoglobin)作用,而不是与色素氧化酶结合的方式,而达到排除毒性的效果。而氰化变性血红素(Cyanomethemoglobin)之後与一种硫化物转移酶-硫氰酸生成酶 (rhodanese)作用,形成硫氰化铵(thiocyanate)错合物。硫氰化铵由肾脏排泄(也就是由尿液排出)。当过多的氰化物进入人体,前述反应机制无法负荷,因而产生毒性。
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